平静的东京湾突然发生海难，当人们还在猜想是否海底火山爆发时，一只巨大的怪兽冒出水面并登陆城区。日本政府主导成立了“巨大不明生物灾害部”，网罗了国家中的奇人异士加盟，研究发现怪兽是受到放射性污染而诞生出来的，命名为哥斯拉；尝试了各种办法均宣告失败的“灾害部”最后不得不决定对哥斯拉采取武装攻击。但是这个巨大的怪兽哥斯拉完成了更恐怖的进化，整个东京将要沦为一片人间地狱，一场人类与怪兽的最终决战即将到...

　　“我与你一同飞向天空。”　　甘粕桧曾根，是最近开始在航空自卫队岐阜基地任职的新人。　　过于率直而总是无意识地伤害他人，对此感到疲惫不堪的她，选择成为任期限定的自卫官。　　但，命运的邂逅彻底改变了她的人生。　　被秘藏在基地中、伪装成战斗机的龙选中了桧曾根，并和她一起飞向天空。　　就这样，搭乘“OTF（变态飞翔生命体）”的飞行要员，　　成为了桧曾根的工作。　　甚至能左右国家命运的龙，　　究竟隐藏着...